Фрэнк Райан - Виролюция. Важнейшая книга об эволюции после «Эгоистичного гена» Ричарда Докинза

• Название: Виролюция. Важнейшая книга об эволюции после «Эгоистичного гена» Ричарда Докинза
• Автор: Фрэнк Райан
• Издательство: Ломоносовъ
• Жанр: Биология
• Год: 2014
• ISBN: 978-5-91678-143-4

Основная идея этой книги шокирует. Все живое на планете, в том числе люди, живут в симбиозе с вирусами, эволюционируют вместе с ними и благодаря им… выживают. Первая реакция читателя: этого не может быть! Но, оказывается, может… Вирусы, их производные и тесно связанные с ними структуры составляют как минимум сорок три процента человеческого генома, что заставляет сделать вывод: естественный отбор у человека и его предков происходил в партнерстве с сотнями вирусов. Но как вирусы встроились в человеческий геном? Как естественный отбор работает на уровне вирус-носитель? Как взаимодействуют движущие силы эволюции — мутации, симбиогенез, гибридизация и эпигенетика? Об этом — логичный, обоснованный научно и подкрепленный экспериментальными данными рассказ Фрэнка Райана.  

---

121

Whitfield J. Lovers, not fighters? New genetic signs that modern humans mated with Homo erectus. Scientific American March 2008; 21.

122

Saey T. Н. First rough draft of Neanderthal genome released. Science News Web Edition 12 February 2009.

123

Ferrier D.E.K., Minguillón C. Evolution of the Hox / ParaHox gene clusters. International Journal of Developmental Biology 2003; 47: 605–611.

124

Gibson T. J., Spring J. Evolution of sequences, structures and genomes. Biochemical Society Transactions 2000; 28 (2): 259–264.

125

Brooke N. M., Garcia-Fernandez J., Holland P. W. H. The ParaHox gene cluster is an evolutionary sister of the Hox gene cluster. Nature 1998; 392: 920–922. See also, Pebusque M.J., Coulier F., Birnhaum D., Pontarotti P. Ancient large-scale genome duplications: phylogenetic and linkage analyses shed light on chordate genome evolution. Molecular Biology and Evolution 1998; 15: 1145–59.

126

McLysaght A., Hokamp K., Wolfe К. H. Extensive genomic duplication during early chordate evolution. Nature Genetics 2002; 2: 128–129.

127

Более подробное описание этих исследований и дальнейшие ссылки можно найти в работе: Ryan F.P. An alternative approach to medical genetics based on modern evolutionary biology. Part 5: epigenetics and genomic duplications. Journal of the Royal Society of Medicine 2009: (in press).

128

Check E. Mix and match: the hunt for what makes us human. Nature «News» 2006; 443: 8.

129

Holmes В. Magic Numbers. New Scientist 8 April 2006: 38–41.

130

Bernaud R., Boyer A., Nègre., et al. Prenatal detection of the 17p11.2 duplication in Charcot-Marie-Tooth disease type 1A: necessity of a multidisciplinary approach for heterogeneous disorders. European Journal of Human Genetics 2002; 10: 297–302.

131

Lucito R., Healy J., Alexander J., et al. Large scale copy number polymorphisms in the human genome. Science 305: 525–528.

132

Redon R., Ishikawa S., Fitch K. R. Global variation in copy number in the human genome. Nature 2006; 444: 444–456.

133

Baird P. А.Reducing birth defects in populations. Centre for Health Services and Policy Research, The University of British Columbia, January 1999. HPRU 99: 4D. http://www.chspr.ubc.ca/files/pubhcations/1999/hpru99-04D.pdf.

134

Yamamoto А., Lucas J.J., Hen R. Reversal of neuropathology and motor dysfunction in a conditional model of Huntington’s disease. Cell 2000: 101: 57–66.

135

PubMed — англоязычная текстовая база данных медицинских и биологических публикаций, созданная Национальным центром биотехнологической информации (NCBI) США на основе раздела «биотехнология» Национальной медицинской библиотеки США. — Прим. ред.

136

Weissmann G. Fashions in science: from philosophers’ camp to epigenetics. The Federation of American Societies for Experimental Biology (FASB) Journal 2008; 22: 4033–7.

137

Телеология — философское учение о целесообразности бытия, оперирующее наличием разумной воли Творца или внутренней силы, потенциально заключающей в себе цель и окончательный результат. — Прим. ред.

138

Stern C.D. Conrad H. Waddington’s contributions to avian and mammalian development, 1930–1940. International Journal of Developmental Biology, 2000; 44: 15–23.

139

Уоддингтон ввел термин «эпигенетический» в своей книге «An introduction to Modem Genetics». London: Allen & Unwin, 1939: 154–156.

140

Spadafora C. A reverse transcriptase-dependent mechanism plays central roles in fundamental biological processes. Systems Biology in Reproductive Medicine 2008; 54: 11–21.

141

Nanney D.L. Epigenetic control systems. Proceedings of the National Academy of Sciences 1958; 44; 712–717.

142

Lyon M. F. Gene action in the X-chromosome of the Mouse (Mus musculus L). Nature 1961; 190: 372–373.

143

Holliday R., Pugh J. Е. DNA modification mechanisms and gene activity during development. Science 1975; 187: 226–232.

144

Riggs A. D. X inactivation, differentiation and DNA methylation. Cytogenetics and Cell Genetics 1975; 14: 9–25.

145

Sagar R., Kitchin R. Selective silencing of eukaryotic gene expression. Science 1975; 189: 426–433.

146

Holliday R. The inheritance of epigenetic defects. Science 1987; 238:163–170.

147

Jablonka E., Lamb M. J. The inheritance of acquired epigenetic variations. Journal of Theoretical Biology 1989; 139: 69–83.

148

Maynard Smith J. Models of a dual inheritance system. Journal of Theoretical Biology 1990; 143: 41–53.

149

Jablonka E., Lachmann M., Lamb M.J. Evidence, mechanisms and models for the inheritance of acquire characteristics. Journal of Theoretical Biology 1992; 158: 245–68.

150

Smith J.M, Szathmáry E. The Origins of Life. Oxford: Oxford University Press, 1999.

151

Jablonka E., Lamb M.J. Epigenetic Inheritance and Evolution: The Lamarckian Dimension. Oxford University Press, Oxford, 1995.

152

Jablonka E., Lamb M. J. Evolution in Four Dimensions. Cambridge, Massachusetts, and London: the MIT Press, 2005.

153

Jablonka E., Raz G. Transgenerational epigenetic inheritance: prevalence, mechanisms, and implications for the study of heredity and evolution. In press, The Quarterly Review of Biology 2009; 84 (2): 31–176.

154

Gilberts. F., Epel D. Ecological Developmental Biology. Sunderland, Massachusetts: Sinauer Associates Inc, 2009: 8.

155

Grant-Downton R.T., Dickinson H. G. Epigenetics and its implications for plant biology. 1. The epigenetic network in plants. Annals of Botany 2005; 96: 1143–64. Grant-Downton R. T., Dickinson H. G. Epigenetics and its implications for plant biology. 2. The «epigenetic epiphany»: epigenetics, evolution and beyond. Annals of Botany 2006; 97: 11–27.

156

Wilson A. G. Epigenetic regulation of gene expression in the inflammatory response and relevance to common diseases. Journal of Periodontology 2008; 79: 1514–9.

157

Godwin J., Luckenbach J.A., Borski R.J. Ecology meets endocrinology: environmental sex determination in fishes. Evolutionary Development 2003; 5 (1): 40–49.

158

Gluckman P.D., Hanson М. А., et al. Effect of the in utero and early life conditions on adult health and disease. New England Journal of Medicine 2008; 359: 61–73.

159

Pugh J.E., Holliday R. Do chemical carcinogens act by altering epigenetic controls through DNA repair rather than by mutations? Heredity 1978; 40: 329.

160

Holliday R. A new theory of carcinogenesis. British Journal of Cancer 1979; 40: 513–522.

161

Holliday R. DNA methylation and epigenotypes. Biochemistry (Moscow) 2005; 70 (5): 500–504. (русскоязычное издание Биохимия 2005; 70 (5): 612–617.

162

Fraga M., Esteller M. Epigenetics and aging: the targets and the marks. Trends in Genetics 2007; 23 (8): 413–418.

163

Fraga M. F., Ballestar E., Paz M.F., et al. Epigenetic differences arise during the lifetime of monozygotic twins. Proceedings of the National Academy of Sciences 2005; 102 (30): 10 604-9.

164

Harper S. Q.S., Taber P.D., Не Х., et al. RNA interference improves motor and neuropathological abnormalities in a Huntington’s disease mouse model. Proceedings of the National Academy of Sciences 2005; 102 (16): 5820–5.

165

Bandea C.I. A new theory on the origin and nature of viruses. Journal of Theoretical Biology 1983; 105: 591–602. Bandea С. I. The origin and evolution of viruses as molecular organisms (new paper under submission).

166

Claverie J.-M. Viruses take center stage in cellular evolution Genome Biology 2006: 7 (6). doi:10.1186/gb-2006–7–6–110.

167

Forterre P. The two ages of the RNA world, and the transition to the DNA world: a story of viruses and cells. Biochemie 2005; 87: 793–803. Forterre P. Three RNA cells for ribosomal lineages and three DNA viruses to replicate their genomes: a hypothesis for the origin of cellular domain. Proceedings of the National Academy of Sciences 2006; 103 (10): 3669–74. Forterre P., Prangishvili D. The great billion-year war between ribosome — and capsid — encoding organisms (cells and viruses) as the major source of evolutionary novelties. Proceedings of the National Academy of Sciences (in press).

168

Lawton G. Uprooting Darwin’s tree. New Scientist 24 January 2009: 34–39.